Фармацевтические исследования можно разбить на следующие 4 стадии:
Drug Discovery. Стадия поиска новых ’’кандидатов" — потенциальных лекарственных препаратов (Lead Candidate). Эта стадия включает синтез новых соединений, скринирование экстрактов из натуральных источников, а также определение активности, специфичности и токсичности лекарств-кандидатов. Для предпочтительных кандидатов рассматриваются каналы метаболизма для быстрого отсева неблагоприятных соединений. На этой стадии масс-спектрометрия является основным аналитическим инструментом и включена в разнообразные научно-исследовательские подходы.
Preclinical Development. Стадия характеризации лекарств-кандидатов. На этой стадии проводят предварительные испытания на культурах клеток и на животных. Кроме того, определяют химические свойства соединения, проверяют, насколько технологичным может быть производство лекарства, и определяют деграданты и метаболиты соединения в биосредах. Определение метаболизма лекарств является важным и ресурсоемким анализом. Здесь абсолютно незаменимы (ЖХ-МС-МС)-методы.
Clinical Development. Стадия клинических испытаний. На этой стадии проводят количественный анализ метаболизма и накопления лекарств в органах и биосредах от пациентов (опять же с помощью ЖХ-МС-МС) из достаточно большого пула. Эти исследования совмещают с общими клиническими исследованиями и проводят корреляцию терапевтического эффекта с приемом лекарств, следят за возможными побочными действиями и определяют оптимальную дозу лекарств.
Производство. После утверждения лекарства происходят оптимизация его производства, определение микропримесей и последующий контроль качества промышленно выпускаемого лекарства. Как правило, используются ГХ-МС, ЖХ-МС - методы.
Drug Discovery — поиск новых лекарств
На первой фармацевтической стадии поиска новых кандидатов (lead candidate) разработан ряд производительных методов, включающих масс-спектрометрию не только как инструмент по контролю результата, но и как активный компонент — инструмент поиска. В 19-м и 20-м веках большинство лекарств экстрагировали из натуральных источников (например, пенициллин). С помощью методов выделения и разделения — экстракции растворителями, фильтрации и хроматографии — эти экстракты разделяли на фракции и выбирали наиболее активные и наименее токсичные фракции. По мере развития аналитической техники удалось определить активные начала (соединения) в таких фракциях, и к середине 20-го века сложилась парадигма, что большинство лекарств — это сравнительно небольшие соединения, которые можно воспроизвести синтетически. Вплоть до начала 90-х основная стратегия создания новых лекарств сводилась к синтезу новых соединений, их очистке, идентификации химической формулы, определению их активности и токсичности на определенном наборе биологических тестов (bio assay) и тем самым определению пригодности соединения как потенциального лекарства. Дальнейший отбор лекарств происходил в испытаниях на культурах клеток, на мышах и собаках, а для отобранных и безопасных лекарств — в клинических испытаниях. Поскольку синтез и очистка соединения занимали недели и месяцы, а количество синтезируемого вещества определялось многими миллиграммами, то аналитические методы тонко-слойной хроматографии и ИК-спектроскопии были приемлемыми для выполнения. Появившиеся в 70-х масс-спектрометрические методы ГХ-МС оказались — более информативными, более удобными и лучше автоматизированными.